国际安全局的特工王尚恩(安志杰 饰)带领万飞(周杰伦 饰)等人前往约旦,负责押送制造天花病毒变种的科学家肯纳。然而,王尚恩背叛了组织,将肯纳劫走,导致万飞头部重伤,他的心上人也在这次任务中不幸遇难。三个月后,王尚恩等人研发的病毒导致一艘货船上的所有人丧命,而他正准备通过出售疫苗牟取暴利;万飞在医院被告知头部的子弹无法取出,神经受损使他在两周后面临生命危险,万母告诉他有一个失散多年的哥哥。为了实现母亲的愿望,万飞前往吉隆坡寻找哥哥万阳(谢霆锋 饰)。在飞机上,万飞的同行者简博士正是王尚恩一伙计划用来替代肯纳的病毒专家。
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