在这个世界中，几乎所有的地方都已经被彻底探索，唯有那个被称为“深渊”的大洞穴仍然是未解开的谜。　　在这个深不可测的垂直洞穴内，栖息着各种奇特的生物，还有现代人类难以复制的珍贵遗物。　　由于“深渊”谜一般的神秘外貌，它吸引着无数冒险者前仆后继。慢慢地，那些反复挑战深渊的冒险者被称为“探窟家”。　　孤儿莉可生活在围绕深渊建造的城镇“奥斯”，她梦想着有一天也能像她母亲一样成为伟大的探窟家，并解开深渊的奥秘。　　某天，她母亲莱萨的白笛被发现，这促使莉可下定决心深入深渊。她遇到了失去记忆的机器人雷格，也决定与她同行，以寻找自己的记忆。　　在深界四层，莉可被穿珠的毒素侵蚀，幸好被名为娜娜奇的“惨剧终末”相救。娜娜奇加入后，三人继续向深界五层彭多尔多所在的地方探险。在那里，他们遇见了一名自称普鲁修卡的女孩。由彭多尔多抚养长大的她对外界一无所知。普鲁修卡被莉可的探险故事深深吸引，希望能与莉可一同冒险，却被彭多尔多用来做实验。　　最终，普鲁修卡转变形态，成为莉可的白笛，与她一同前往深界六层“不可返回之都”。在那里，有一个“惨剧终末的村庄”，是拥有独特价值观的“惨剧终末”们的居所。