在朱由桦行刑的那天，他神秘地消失了，梅儿和兰心因此受到惩罚。尽管太子反对，兰心坚持要把朱由桦送还给三皇子，却发现马车上的孩子竟消失无踪。在此过程中，兰心与太子之间的感情出现了裂痕，而梅儿和金碧瑶则全力以赴地争取太子的宠爱。太子与万历等人一同去郊外狩猎，途中有人企图暗杀太子，梅儿为太子挡了一箭，命悬一线，太子为此感动不已，觉得亏欠梅儿甚多。上官鸿业开展对太子刺杀事件的调查，却意外发现幕后真凶并非众人所认为的三皇子，而是梅儿。在梅儿册封的当天，郑贵妃揭露了梅儿身为娼妓之女的秘密，使梅儿无法受封。此时，郑贵妃趁机指使亲信对上官鸿业进行弹劾，兰心为了救父心切，却误解了太子，两人再次不欢而散。失踪多日的朱由桦突然出现在兰心的房间中，兰心将他放入篮子中带往宫中，却被梅儿换成了璇儿。兰心带着“朱由桦”进宫，途中巧遇为上官鸿业说情的太子，导致又一次误会。在王恭妃和郑贵妃的施压下，太子持剑杀死了璇儿，等他回过神来璇儿早已失去生命。兰心悲痛欲绝，带着幸存的朱由桦离开，太子骑马追赶，却未能找到他们的踪迹。皇上以太子妃之位不可久空为由，册封大学士王中泽的女儿王氏为太子妃。