在20世纪末，科学家们发现了一种神秘的物质，被称为“B细胞”，它存在于生物体内，并能够直接侵入生物的DNA，引发变异。这一发现引起了科学界的浓厚兴趣，促使他们进行大量的动物实验，并秘密计划将B细胞用于人体实验。在此过程中，高中生海堂佑司无意中成为了实验的受害者，由于B细胞的活性被激发，他被诊断为不治之症，并被送入精心安排的冷冻睡眠。 与此同时，动物体内的B细胞在冷冻状态下无法被抑制，导致其突变并大量增殖，进而引发了物种变异，普通的兔子和狗被转变成了巨型虫状怪物BLUE。这些生物在短时间内迅速繁殖，并开始以人类为食。在很短的时间内，BLUE的数量急剧膨胀，迅速占领了整个世界。只有约一千万人被选中逃往了太空殖民地“第二地球”，其余的人则被迫留在地面，成为BLUE的猎物。 这场灾难并非源于天灾或虫灾，而是人类自身的所作所为导致的结果。人类亲手制造了这样的罪孽，再次将自己推向了无尽的深渊。